在受感染的患者体内，HCV随血液循环可与脂蛋白结合，有几类分子能帮助HCV黏附并进入肝细胞。包括其表面的糖蛋白和素主来源的第一密度脂蛋白，随后HCV通过内吞作用进入细胞，病毒包膜与细胞膜融合从而释放和一枪，和一窍是由核心蛋白构成的包膜及其内涵的病毒遗传物质单链RNA所组成。
丙肝
病毒RNA通过翻译过程在内置网形成一个单一大型多具蛋白，包含结构和非结构蛋白，每种蛋白参与不同的生物学过程，该多具蛋白经素主和病毒来源的霉切割成为独立的蛋白结构。
其中的ns3与ns4a又可形成复合物切割剩余的蛋白，ns5a是一种多功能蛋白，可与多种素主和病毒的蛋白相互作用。具有三个结构预组成，在复制和装配过程中发挥必要作用。
Ns5a可作为复制复合物中其他蛋白分子的支架，ns5a利用新离子形成2具体，这个2具体有助于HCVRNA的结合。若缺少ns5a，则复制复合物无法形成，病毒复制也就不会发生。
Ns5b是一种RNA依赖的RNA多聚酶，可以利用病毒RNA作为模板进行复制，产生新的病毒拷贝，新合成的病毒RNA等待被装配入新的病毒中。Ns5a还参与病毒的装配过程。
丙肝
表面的核心蛋白与ns5a相互作用，使病毒RNA能够被包装，进入核一窍。最后还需要有病毒包膜并切入表面的糖蛋白。新装配完成的HCV病毒粒子将被释放出去，这些具有传染性的颗粒可侵入周围的肝细胞，大约70％到80％的急性感染者可进展为慢性HCV感染。
经过多年的进展过程，对肝脏造成践行性损伤，可导致严重的并发症。包括肝衰竭和肝细胞癌，历经多年研究，现在对于饼干病毒生命周期已经有了更透彻的了解。
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