许多心脏疾病作为栓塞的潜在来源。栓塞的风险是多种多样的。较常见的高风险心脏栓塞病是心房颤动，心肌梗塞，机械性人工瓣膜，扩张型心肌病和二尖瓣风湿性狭窄。心脏栓塞的其他主要来源包括感染性心内膜炎，马兰氏心内膜炎和心房粘液瘤。
心源性脑栓塞的次要来源是未闭卵圆孔，房间隔动脉瘤，心房或心室中隔缺损，钙化性主动脉狭窄和二尖瓣环钙化。
心房颤动
心房颤动是心源性脑梗塞的最重要的原因
心房颤动是最常见的持续性心律不齐。心房颤动的患病率随年龄增长而增加，在65岁以上的人群中达到5％的峰值，并且其发生率和患病率都在增加。该疾病与瓣膜性心脏病，甲状腺疾病，高血压和近期大量饮酒有关。
心房纤颤现在主要继发于缺血性或高血压性心脏病。心房颤动引起的中风风险从50岁时的1.5％上升到80岁时的24％。
非瓣膜性房颤患者中风的发生率估计是非瓣膜性房颤患者的2到7倍，而瓣膜性心房颤动的患者中风的发生率比年龄匹配的对照组高17倍。慢性和复发性心房纤颤似乎具有非常相似的中风风险。
在没有器质性心脏病或高危因素的情况下发生房颤（孤独性心房颤动）的风险似乎要低得多，尤其是在年轻患者中（每年约1.3％）。
心房颤动会导致中风，因为它导致收缩不足，并导致左心耳最明显的淤滞。血瘀与纤维蛋白原，D-二聚体和von Willebrand因子浓度升高有关，这表明血栓形成前状态。
在这些患者中，左心室功能障碍和左心房大小是后期血栓栓塞的独立超声心动图预测指标。与特别高的栓塞风险相关的其他因素是通过食管超声心动图检测到的自发回声对比，左心房血栓或主动脉斑块。心力衰竭，高血压，年龄> 75岁和糖尿病以中度但加和的方式增加中风的风险。
心房颤动
心动过缓-心动过速（病窦）综合征可能与脑栓塞事件有关。
约有2.5％的急性心肌梗塞患者在梗塞后2至4周内发生中风，而在接下来的6年内，将有8％的男性和11％的女性发生缺血性中风。
增加中风风险的因素包括严重的左心功能不全，心输出量低，左心室动脉瘤或血栓，以及相关的心律不齐，例如心房颤动。
与射血分数大于35％的患者相比，射血分数小于28％的患者的中风相对危险度为1.86。早期栓塞的发病率较高，可能高达22％的附壁血栓的存在和是最有可能发生的血栓是移动或突出到心室。中风风险增加24%心房颤动是引起脑梗死的一种心脏病
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