大多数先天性胃肠道 （GI） 异常会导致某种类型的肠梗阻，通常表现为在出生时或出生后 1 或 2 天内出现喂养困难、腹胀和呕吐。一些先天性胃肠道畸形，
如旋转不良，预后非常好，而另一些，如先天性膈疝，预后较差（死亡率为 10％ 至 30％）。
先天性胃肠道异常
一种常见的异常类型是闭锁，其中胃肠道的一部分无法正常形成或发育，或者它形成然后被宫内事件（血管破裂）破坏。最常见的类型是食管闭锁，其次是空肠回肠区和十二指肠闭锁。
立即处理包括肠道减压（通过持续鼻胃吸引术以防止呕吐，这会导致吸入性肺炎或进一步的腹胀伴呼吸系统损害）和转诊至新生儿手术中心。同样重要的是
保持体温，通过静脉注射 10％ 葡萄糖和电解质预防低血糖，以及预防或治疗酸中毒和感染，以便婴儿处于手术的最佳状态。
因为大约三分之一的胃肠道畸形婴儿有另一种先天性异常（先天性膈疝高达 50％，脐膨出高达 70％ ），他们应该评估其他器官系统的畸形，尤其是中枢神经系统、心脏和肾脏。
高消化道阻塞
当诊断出羊水过多（羊水过多）时，应考虑食管、胃、十二指肠和空肠梗阻，因为这些梗阻会阻止胎儿吞咽和吸收羊水。
先天性胃肠道异常
在分娩后心血管稳定后，应立即将鼻胃管插入新生儿的胃中。在胃中发现大量液体，尤其是胆汁染色时，支持上消化道梗阻的诊断，而无法将导管插入胃内则提示
食管闭锁（或鼻塞[例如后鼻孔闭锁]）。
由于空肠回肠闭锁、旋转不良或胎粪性肠梗阻，可导致空肠和回肠阻塞。大肠梗阻通常由胎粪栓综合征或结肠或肛门闭锁引起。
在 75％ 的病例中，不存在母体羊水过多病史，因为大部分吞咽的羊水可以从梗阻近端的肠道吸收。除了旋转不良、肠重复和先天性巨结肠，这些疾病通常在出生后的最初
几天出现喂养问题、腹胀和呕吐，可能是胆汁或粪便。新生儿最初可能会排出少量胎粪，但之后不会排便。旋转不良、肠道重复和先天性巨结肠可在生命的最初几天或几年后出现。
一般诊断方法和术前管理包括以下内容：嘴上什么都不给
先天性胃肠道异常
放置鼻胃管以防止进一步的肠胀气或可能的呕吐物误吸
纠正液体和电解质紊乱
拍一张普通的腹部 X 光片
做对比灌肠来描绘解剖结构（灌肠也可以缓解胎粪堵塞综合征或胎粪肠梗阻）
对于先天性巨结肠，需要进行直肠活检。
腹壁闭合缺陷
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